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Propósito: Identificar variantes genéticas raras de la degeneración macular asociada a edades tempranas (AMD) utilizando la secuenciación del exoma completo (WES).
Métodos: Se determinaron ocho familias no relacionadas con AMD temprana de diferentes etnias judías. La prueba inicial de mutación (fase 1) abarcaba el factor H del complemento común (CFH) p.Y402H; y la proteína 2 de susceptibilidad a la maculopatía asociada a la edad (ARMS2) p. A69S; y variantes raras del factor I del complemento (CFI) p.V412M; y hemicentina-1 (HMCN1) c.4163deIC identificada previamente en nuestra población. Cuatro familias, cuya prueba inicial para las variantes anteriormente mencionadas fue negativa, se sometieron a WES (fase 2). El análisis bioinformático se basó en la funcionalidad (de un panel de 234 genes con una comprobada o presunta asociación al AMD); gravedad prevista, y frecuencia (variantes raras con frecuencia del alelo menos común <1%). Cuando fue aplicado, se llevó a cabo una evaluación posterior para variantes raras específicas en casos adicionales de etnias y fenotipos similares (fase 3).
Resultados: La fase 1 identificó tres familias portadoras de la mutación del CFI p.V412M. Los análisis de WES detectaron probables variantes relacionadas con la enfermedad en tres de las familias restantes. Estos incluyen: una familia con una variante del gen PLEKHA1 p.S177N; una familia con una variante del gen CFH p.R1210C previamente reportada; y dos familias con la variante C3 p.R735W.
Conclusiones: Las variantes raras de alta penetración tienen una profunda contribución a la patogénesis de la AMD temprana. El uso de WES en investigación genética de enfermedades multifactoriales como la AMD, permite un análisis exhaustivo completo con la identificación de las variantes raras previamente no reportadas.
DOI: 10.3390/genes10100825 PMID: 31635417
Declaración de conflicto de intereses: Los autores declaran no tener ningún conflicto de intereses. Los financiadores no tuvieron ningún papel en el diseño del estudio; en la recopilación, análisis, o interpretación de los datos; en la elaboración del manuscrito, o en la decisión de publicar los resultados.
Autor/es: Shoshany N, Weiner C, Safir M, Einan-Lifshitz A, Pokroy R, Kol A, Modai S, Shomron N, Pras E.
Traductor/a: José Antonio Tanco Ochoa
